Родился 2 апреля 1922 года. В 1937 – 1941 годы учился в Газахском педагогическом техникуме. В 1941 – 1945 годы участвовал во II Мировой войне. В 1951 году окончил исторический факультет БГУ. Приступил к научной деятельности в должности младшего научного сотрудника в Музее истории Азербайджана. В 1952 – 1958 годы работал руководителем археологического фонда музея, с 1956 года возглавлял Палеолитическую археологическую экспедицию, нашел и исследовал палеолитические лагеря Дамджилы и Дашсалахлы в Газахском районе. С 1960 года руководил Карабахской палеолитической экспедицией, созданной Институтом истории АНА, открыл пещерные лагеря Азых и Таглар. Изучение “азыхантропа” - древнего обитателя Азыхской пещеры, охватывающей все этапы развития древнего каменного века, принесло талантливому ученому мировую славу. С его именем непосредственно связано выявление и изучение памятников, относящихся к древнему каменному веку в Азербайджане. В 1960 году успешно защитил кандидатскую, а в 1985 году – докторскую диссертацию, в 1987 году был удостоен ученого звания профессора. Проф. М.М.Гусейнов был известен также как видный организатор науки и талантливый педагог. В 1971 – 1994 годы являлся первым заведующим археологическим отделом каменного века в Институте истории АНА, а в 1976 – 1992 годы возглавлял кафедру археологии и этнографии Бакинского государственного университета. Автор десятка крупных монографий и учебных пособий, более 100 статей. По его инициативе и усилиями на историческом факультете был создан музей археологии и этнографии. В настоящее время музей носит имя М.М.Гусейнова.